Tutti gli articoli di Luca Ferretti

Postdoctoral position available at the Candiolo Cancer Institute-IRCCS (Torino, Italy)

The Candiolo Cancer Institute-IRCCS (Institute for Cancer Research and Treatment) is a private non-profit institute situated near Torino (http://www.ircc.it/irccit/?q=IRCC). The core of the Institute is at the interface between molecular biology and precision medicine. The new Jumping Genes Lab (http://www.ircc.it/irccit/?q=Jumping-Genes-Lab) is now recruiting an outstanding, creative Postdoctoral Fellow with expertise in CRISPR/Cas9 genetic engineering to cut out retrotransposon (jumping gene) insertions from human cell lines.

 

The laboratory investigates the impact of various retroelements on cancer, including LINE-1 retrotransposons (L1s). The Postdoctoral Fellow would perform various functional genetic assays on transposons. A major goal is to determine whether these elements can cause cancer and how frequently they are involved in tumorigenesis. To this end, the successful applicant will seamlessly remove and then re-insert putative cancer-driver L1 insertions from patient-derived cell lines and will monitor the phenotype of the cells. The fellow will also have the possibility to analyze somatic retrotransposon insertions in human tumors and plasma. To this end, prior work with human tissues can be an advantage. However, the only requirement is experience with CRISPR technology and cell culturing. Experience with genetic engineering methods other than CRISPR is also considered. Prior work with mobile elements is a plus, but not required. Excellent English communication skills are necessary. IRCCS provides cutting-edge equipment and core facilities. Applications including a European style CV and a summary of past accomplishments should be sent to szilvia.solyom@ircc.it.

 

Recent publications:
Ewing AD, Gacita A, Wood LD, Ma F, Xing D, Kim MS, Manda SS, Abril G, Pereira G, Makohon-Moore A, Looijenga LHJ, Gillis AJM, Hruban RH, Anders RA, Romans KE, Pandey A, Iacobuzio-Donahue CA, Vogelstein B, Kinzler KW, Kazazian HH Jr, Solyom S: Widespread somatic L1 retrotransposition occurs early during gastrointestinal cancer evolution. Genome Res. 2015 Aug, pii: gr.196238.115.

Solyom S*, Ewing AD*, Rahrmann EP, Doucet D, Nelson HH, Burns MB, Harris RS, Sigmon DF, Casella A, Erlanger B, Wheelan S, Upton KR, Shukla R, Faulkner GJ,  Largaespada DA, and Kazazian HH Jr: Extensive somatic L1 retrotransposition in colorectal tumors. Genome Res. 2012 Dec;22(12):2328-2338. *equal contribution

Solyom S and Kazazian HH Jr: Mobile elements in the human genome: implications for disease. Genome Medicine 2012 Feb;4(2):12.
Solyom S*, Ewing AD*, Hancks DC*, Takeshima Y, Awano H, Matsuo M, Kazazian HH Jr: Pathogenic orphan transduction created by a non-reference LINE-1 retrotransposon. Hum Mutat. 2012 Feb;33(2):369-371. *equal contribution

Ranzani Guglielmina Nadia

Ranzanifoto90

Professore Ordinario – BIO/18 Genetica

Telefono: +39 0382 98 5564 (Uff); 5537 (Lab)
Fax: +39 0382 528496
Skype: nadiaranzani
Email: guglielmina.ranzani@unipv.it
Orari di ricevimento studenti: per appuntamento da concordare via Email

Insegnamenti a.a. 2017-2018

  • Genetica molecolare umana (9 CFU) Laurea Magistrale in Biologia Sperimentale ed Applicata-percorso Scienze Biomediche Molecolari
  • Human Molecular Genetics (6 CFU) Laurea Magistrale in Molecular Biology and Genetics

Insegnamenti a.a. 2016-2017

  • Genetica molecolare umana (9 CFU) Laurea Magistrale in Biologia Sperimentale ed Applicata-percorso Scienze Biomediche Molecolari
  • Human Molecular Genetics (6 CFU) Laurea Magistrale in Molecular Biology and Genetics


Curriculum
Pubblicazioni  Google_scholar
Attività di ricerca: Basi molecolari delle patologie umane

Achilli Alessandro

Professore Associato BIO/18 – Genetica

Telefono: ++39 0382 985560
Fax: + 39 382 528496
Email: alessandro.achilli@unipv.it
Orari di ricevimento: per appuntamento da concordare via mail.

Insegnamenti a.a. 2017-2018

  • Genetica Molecolare (6 CFU – Cod 501555) – Laurea Triennale in Biotecnologie
  • Metodologie Genetico-Molecolari (6 CFU – Cod 500749) –  Laurea Magistrale in Biologia Sperimentale e Applicata

Insegnamenti a.a. 2016-2017

  • Genetica Molecolare (6 CFU – Cod 501555) – Laurea Triennale in Biotecnologie
  • Metodologie Genetico-Molecolari (6 CFU – Cod 500749) –  Laurea Magistrale in Biologia Sperimentale e Applicata


Curriculum
Pubblicazioni  Google_scholar
Attività di ricerca: Genomica di popolazioni umane ed animali

 

De Rossi Edda

Professore Associato – BIO/19 Microbiologia Generale

Telefono: ++39 0382 98 5561
Fax: ++39 0382 987917
Email: edda.derossi@unipv.it
Orari di ricevimento: per appuntamento da concordare via mail

Insegnamenti a.a. 2017-2018

  • Microbiologia (9 CFU) Laurea Triennale in Scienze Biologiche
  • Analisi microbiologiche (6 CFU) Laurea Magistrale in Biologia Sperimentale ed Applicata
  • Microbiologia applicata (6 CFU) Laurea Magistrale in Biotecnologie Avanzate
  • Citologia e Istologia (Corso A 6 ore, Corso B 6 ore) Laurea triennale in Scienze Biologiche

Insegnamenti a.a. 2016-2017

  • Microbiologia (9 CFU) Laurea Triennale in Scienze Biologiche
  • Analisi microbiologiche (6 CFU) Laurea Magistrale in Biologia Sperimentale ed Applicata
  • Microbiologia applicata (6 CFU) Laurea Magistrale in Biotecnologie Avanzate
  • Citologia e Istologia (Corso A 6 ore, Corso B 6 ore) Laurea triennale in Scienze Biologiche


Curriculum
Pubblicazioni
Attività di ricerca: Microbiologia Molecolare

Semino Ornella

Professore Associato – BIO/18 Genetica

Telefono ++39 0382 985543 (Uff)
++39 0382 985544 (Lab)
Fax ++39 0382 528496
Skype: ornella.semino1
E-mail ornella.semino@unipv.it
Siti web per corsi sulla piattaforma kiro
Genetica e biologia umana: http://elearning3.unipv.it/terra/course/view.php?id=57
Genetica: http://elearning2.unipv.it/bio/course/view.php?id=16
Orari di ricevimento: per appuntamento

Insegnamenti a.a. 2017-2018

  • Genetica e Biologia Umana (9 CFU) Laurea in Scienze e Tecnologie per l’Ambiente e la Natura
  • Genetica (6 CFU) Laurea Triennale in Scienze Biologiche

Insegnamenti a.a. 2016-2017

  • Genetica e Biologia Umana (9 CFU) Laurea in Scienze e Tecnologie per l’Ambiente e la Natura
  • Genetica (6 CFU) Laurea Triennale in Scienze Biologiche


Curriculum
Pubblicazioni  Google_scholar
Attività di ricerca: Genomica di popolazioni umane ed animali

Torroni Antonio

Torronifoto20139

Professore Ordinario – BIO/18 Genetica 

Telefono ++39 0382 98 5563 (Uff) 5553 (Lab)
E-mail antonio.torroni@unipv.it

Insegnamenti a.a. 2017-2018

  • Genetica (5 CFU, Corso A)  Laurea triennale in Biotecnologie
  • Genetica (5 CFU, Corso B) Laurea triennale in Biotecnologie
  • Genetica della Conservazione (Modulo 3 CFU) Laurea Magistrale in Scienze della Natura e Laurea Magistrale in Biologia Ambientale e Biodiversità
  • Citologia e Istologia (Corso A 4 ore, Corso B 4 ore) Laurea triennale in Scienze Biologiche

Insegnamenti a.a. 2016-2017

  • Genetica (5 CFU, Corso A)  Laurea triennale in Biotecnologie
  • Genetica (5 CFU, Corso B) Laurea triennale in Biotecnologie
  • Genetica della Conservazione (Modulo 3 CFU) Laurea Magistrale in Scienze della Natura e Laurea Magistrale in Biologia Ambientale e Biodiversità
  • Citologia e Istologia (Corso A 4 ore, Corso B 4 ore) Laurea triennale in Scienze Biologiche

Curriculum
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Attività di ricerca: Genomica di popolazioni umane ed animali

12 marzo 2016 – LBS in visita all’ITAS Gallini di Voghera

La Prof.ssa De Rossi, Presidente del Consiglio Didattico di Scienze Biologiche, e il Prof. Ferretti, coordinatore del corso di studi di Biotecnologie, su invito della Prof.ssa Galbusieri hanno visitato l’ITAS Gallini, compresi i laboratori per le attività pratiche degli studenti, in particolare quelli recentemente organizzati in previsione dei nuovi programmi scolastici relativi alle materie biologiche e biotecnologiche.

E’ seguito poi un incontro con gli studenti di 4a e 5a mirato alla presentazione dei corsi di laurea delle classi di Scienze Biologiche e Scienze Biotecnologiche di cui è responsabile il Dipartimento di Biologia e Biotecnologie dell’Università di Pavia, presso il quale lavorano i Proff. De Rossi e Ferretti.

Olivieri Anna

Olivieri

Ricercatore a tempo determinato (RTD, tipo B senior) – BIO/18 Genetica

Telefono: ++39 0382 98 5553 (Lab)
Email: anna.olivieri@unipv.it
Siti web per corsi sulla piattaforma kiro
Genetica: http://elearning2.unipv.it/bio/course/view.php?id=77
Orari di ricevimento: per appuntamento da concordare via mail

Insegnamenti a.a. 2017-2018

  • Genetica (3 CFU Modulo 2) Laurea Triennale in Scienze Biologiche
  • Genetica della Conservazione (3 CFU) Laurea Magistrale in Scienze della Natura e Laurea Magistrale in Biologia Sperimentale e Applicata

Insegnamenti a.a. 2016-2017

  • Genetica (3 CFU Modulo 2) Laurea Triennale in Scienze Biologiche
  • Genetica della Conservazione (3 CFU) Laurea Magistrale in Scienze della Natura e Laurea Magistrale in Biologia Sperimentale e Applicata


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Pubblicazioni  Google_scholar
Attività di ricerca: Genomica di popolazioni umane ed animali

Seppi Claudio

Ricercatore – BIO/10 Biochimica

Telefono: ++39 0382 98 7243
Email: claudio.seppi@unipv.it
Siti web per corsi sulla piattaforma kiro:
Metodologie ed Analisi Biochimico Cliniche
http://elearning2.unipv.it/bio/course/view.php?id=51
Orari di ricevimento: per appuntamento da concordare via mail

Insegnamenti a.a. 2017-2018

  • Metodologie ed Analisi Biochimico Cliniche (9 CFU) Laurea Magistrale in Biologia Sperimentale ed Applicata

Insegnamenti a.a. 2016-2017

  • Metodologie ed Analisi Biochimico Cliniche (9 CFU) Laurea Magistrale in Biologia Sperimentale ed Applicata


Curriculum
Pubblicazioni
Attività di ricerca: Genetica, genomica e biotecnologie microbiche

8 marzo 2016 – Liceo Scientifico Statale “Filippo Lussana”

La classe 4B del Liceo Scientifico “F. Lussana” di Bergamo ha trascorso l’intera giornata dell’8 marzo presso il Laboratorio di Biologia Sperimentale e il Dipartimento di Biologia e Biotecnologie, visitando laboratori di ricerca del Dipartimento, seguendo lezioni universiyari e svolgendo attività pratiche nei laboratori didattici dell’LBS.

Programma della giornata

Ore 9:00 – 11:00. Arrivo, ttasferimento in Dipartimento, accoglienza da parte della Prof.ssa De Rossi. Breve illustrazione del Campus Universitario e vista del Dipartimento di Biologia e Biotecnologie, di alcuni laboratori di ricerca e colloqui con alcuni ricercatori.

Ore 11:00 – 13:00. Lezione assieme agli studenti universitari del corso di Microbiologia di Scienze Biologiche (triennale)

pausa pranzo

Ore 14:00 – 17:00. Trasferimento nel laboratorio didattico D2 dell’LBS e svolgimento di attività pratiche. Osservazione al microscopio ottico di preparati in vivo (Saccaromyces cerevisiae e Spirulina platensis) e fissati (Saccaromyces cerevisiae).

Presentazione della offerta formativa del Dipartimento di Biologia e Biotecnologie: corsi triennali e magistrali di Biotecnologie e Scienze Biologiche.

29/2/16 – ITAS Gallini Voghera

Classe ospitata: 4A (BA) 25 studenti accompagnati dagli insegnanti Prof.ssa Galbusieri e Prof. Rizzi

Durante la giornata gli studenti hanno imparato a preparare una miscela di ligasi utilizzando un vettore plasmidico  e un inserto rappresentato da un DNA amplificato mediante PCR. L’attività ha previsto una lezione sul meccanismo dell’alfa-complementazione della beta-Galattosidasi nel ceppo di E. coli DH5alfa. Gli studenti hanno poi trasformato la miscela di ligasi in cellule competenti del ceppo DH5alfa preparando autonomamente le piastre di terreno selettivo. L’attività è stata completata da una lezione sul meccanismo della trasformazione e della competenza.

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Test d’ingresso di Lingua Inglese per gli studenti di Biotecnologie

Si avvisano gli studenti del 1 anno di Biotecnologie che è previsto un test d’ingresso di Lingua Inglese il giorno Mercoledì 2 marzo 2016 in Aula B 4 (Ingegneria):
– Gruppo A dalle ore 14,15 alle ore 15,15
– Gruppo B dalle ore 15,15 alle ore 16,15.
Si ricorda agli studenti che le lezioni di Lingua Inglese avranno inizio Lunedì 7 marzo dalle ore 14 alle ore 16 in Aula V di Chimica Organica

25/2/16 – Progetto DNA chiavi in mano – Liceo Classico Verri di Lodi

Classi ospitate: 4A e 4B 16 studenti accompagnati dagli insegnanti Prof.ssa Cazzani e  Prof.ssa Comisi

Questa attività è parte di un progetto, chiamato “DNA chiavi in mano” che la Prof.ssa Cazzani organizza presso la propria scuola (ITE Bassi di Lodi) offrendo attività di laboratorio pratiche sia agli studenti del Bassi che a scuole che aderiscono al progetto. L’LBS entra nel progetto “DNA chiavi in mano” per la fase finale che prevede un’attività pratica di clonaggio molecolare svolta presso l’LBS sia dagli studenti del Bassi sia dagli studenti delle scuole aggregate al progetto “DNA chiavi in mano”.

Durante la giornata gli studenti hanno imparato a preparare una miscela di ligasi utilizzando un vettore plasmidico  e un inserto rappresentato da un DNA amplificato mediante PCR. L’attività ha previsto una lezione sul meccanismo dell’alfa-complementazione della beta-Galattosidasi nel ceppo di E. coli DH5alfa. Gli studenti hanno poi trasformato la miscela di ligasi in cellule competenti del ceppo DH5alfa preparando autonomamente le piastre di terreno selettivo. L’attività è stata completata da una lezione sul meccanismo della trasformazione e della competenza.

17/2/16 – Istituto ITIS Caramuel di Vigevano

Classi ospitate: 5E Ist. tecnico – Chimica e Biotecnologie; 5A e 5B Lic Scientifico.
Docenti accompagnatori: Proff. Arpa Mara, Gandolfo Rosa Marina; Gobbi Mariagrazia; Mandrino Annamaria.

Attività svolta
Durante la giornata gli studenti sono stati suddivisi nei laboratori didattici D1 e D2 e hanno eseguito individualmente

  • l’amplificazione mediante PCR di una porzione di un gene ribosomale di Saccarmyces cerevisiae partendo da una singola colonia;
  • la digestione del prodotto amplificato con l’enzima di restrizione EcoRI;
  • la separazione su gel di agarosio del prodotto amplificato prima e dopo il taglio con l’enzima EcoRI

Durante le pause dell’attività pratica gli studenti hanno seguito lezioni teoriche sui principi dell’amplificazione di DNA, sulla elettroforesi e sugli enzimi di restrizione.

16-17/12/15 – Formazione docenti: PCR, enzimi di restrizione, elettroforesi

L’attività è stata svolta in collaborazione con ANISN, sezione di Pavia,  nel contesto del Piano Lauree Scientifiche come primo incontro di formazione docenti di scuole superiori su argomenti segnalati dai docenti stessi in quanto rilevanti per i programmi scolastici degli istituti superiori interessati.

Lo scopo delle due giornate di formazione è stato quello di aggiornare i docenti sull’argomento “PCR, enzimi di restrizione, elettroforesi” concordato precedentemente e farli partecipare ad attività di laboratorio che potessero poi essere trasferite nelle proprie scuole. Nel periodo successivo alle giornate di formazione è stat fornita assistenza e supporto per l’acquisto di materiali ai docenti intenzionati a ripetere le esperienze nei propri istituti.

Attività svolta
Nel corso delle due giornate i docenti hanno eseguito individualmente

  • l’amplificazione mediante PCR di una porzione di un gene ribosomale di Saccaromyces cerevisiae partendo da una singola colonia;
  • la digestione del prodotto amplificato con l’enzima di restrizione ApaI;
  • la separazione su gel di agarosio del prodotto amplificato prima e dopo il taglio con l’enzima ApaI

Durante le pause dell’attività pratica i docenti intervenuti hanno seguito lezioni teoriche sui principi dell’amplificazione di DNA, sulla elettroforesi e sugli enzimi di restrizione.