Giovedi 18 maggio ore 8:30 – 13:30

Partecipanti: 34 studenti di V (indirizzo Scienze Applicate) dell’Istituto Tecnico Industriale Statale “G. Cardano” di Pavia. Referente scolastico: Prof. Marinoni

Sede: Laboratorio di Biologia Sperimentale, Aula D1 e D2 – Polo Didattico di Ingegneria, Via Ferrata

PCR & Elettroforesi

Docenti: prof. Luca Ferretti e prof.ssa Edda De Rossi, Dipartimento di Biologia e Biotecnologie “L. Spallanzani”

L’attività prevede

• Estrazione rapida di DNA di lievito da colonia
• Amplificazione in vitro di DNA (PCR)
• Analisi dei prodotti di amplificazione mediante elettroforesi su gel di agarosio

Giovedi 27 aprile 2017 ore 14:30 – 18:00,

Sede: Laboratorio di Biologia Sperimentale, Aula D2 – Polo Didattico di Ingegneria, Via Ferrata

Alla ricerca della mia “Eva” – Analisi di profili genetici individuali di DNA mitocondriale – parte seconda

Docenti: prof. Luca Ferretti e prof.ssa Edda De Rossi, Dipartimento di Biologia e Biotecnologie “L. Spallanzani”

Settimo incontro del ciclo Approfondiamo le Biotecnologie, corso di formazione per insegnanti di Scienze e Chimica di scuole secondarie di primo e secondo grado organizzato dalla Associazione Nazionale Insegnanti Scienze Naturali – Sezione di Pavia (ANISN) con la partecipazione del DBB nel contesto del Piano Nazionale Lauree Scientifiche.

L’attività prevede

• Analisi dei risultati del sequenziamento della regione ipervariabile del DNA mitocondriale amplificata nell’attività precedente (4 aprile 2017)
• Lettura delle sequenze e generazione degli aplotipi individuali
• allineamento delle sequenze e costruzione di un albero filogenetico dei DNA mitocondriali sequenziati
• lezione sulla variabilità del mtDNA e sulla filogenesi molecolare

Martedi 4 aprile 2017 ore 14:30 – 18:00,

Sede: Laboratorio di Biologia Sperimentale, Aula D2 – Polo Didattico di Ingegneria, Via Ferrata

Alla ricerca della mia “Eva” – Analisi di profili genetici individuali di DNA mitocondriale – parte prima

Docenti: prof. Luca Ferretti e prof.ssa Edda De Rossi, Dipartimento di Biologia e Biotecnologie “L. Spallanzani”

Sesto incontro del ciclo Approfondiamo le Biotecnologie, corso di formazione per insegnanti di Scienze e Chimica di scuole secondarie di primo e secondo grado organizzato dalla Associazione Nazionale Insegnanti Scienze Naturali – Sezione di Pavia (ANISN) con la partecipazione del DBB nel contesto del Piano Nazionale Lauree Scientifiche.

L’attività prevede

• estrazione di DNA mediante swab buccale
• quantificazione del DNA estratto con fluorimetro
• PCR della regione ipervariabile del DNA mitocondriale
• lezione sulla variabilità del mtDNA con la spiegazione dei concetti di aplotipo e aplogruppo

Classe ospitata: 13 studenti delle classi 4BC, 4AC, 3G, 3F, 3O e 5C del liceo classico Verri e dell’I.T.E.T. A. Bassi di Lodi

Data: 28 marzo 2017 presso i laboratori dell’LBS

L’attività conclude il percorso laboratoriale del progetto “DNA chiavi in mano” con un’attività ci clonaggio molecolare.

Nel corso della giornata gli studenti preparano una reazione di ligasi utilizzando un vettore plasmidico  e un inserto rappresentato da un DNA ribosomale di lievito (Saccharomyces cerevisiae) amplificato mediante PCR.  In seguito trasformano la miscela della reazione di ligasi in cellule competenti del ceppo di E. coli DH5alfa preparando autonomamente le piastre di terreno selettivo.

Le attività pratiche sono accompagnate da lezioni sul meccanismo dell’alfa-complementazione della beta-Galattosidasi nel ceppo di E. coli DH5alfa e sul meccanismo della trasformazione e della competenza.

I risultati dell’esperimento vengono esaminati nei giorni successivi con gli insegnanti che poi ne discutono in classe con gli studenti.

Classe ospitata: classe 5a del Liceo Linguistico “W. Shakespeare di Crema”

Data: 21 marzo 2017 presso i laboratori dell’LBS

L’attività conclude il percorso laboratoriale del progetto “DNA chiavi in mano” con un’attività ci clonaggio molecolare.

Nel corso della giornata gli studenti preparano una reazione di ligasi utilizzando un vettore plasmidico  e un inserto rappresentato da un DNA ribosomale di lievito (Saccharomyces cerevisiae) amplificato mediante PCR.  In seguito trasformano la miscela della reazione di ligasi in cellule competenti del ceppo di E. coli DH5alfa preparando autonomamente le piastre di terreno selettivo.

Le attività pratiche sono accompagnate da lezioni sul meccanismo dell’alfa-complementazione della beta-Galattosidasi nel ceppo di E. coli DH5alfa e sul meccanismo della trasformazione e della competenza.

I risultati dell’esperimento vengono esaminati nei giorni successivi con gli insegnanti che poi ne discutono in classe con gli studenti.

Attività di promozione del laboratorio di scienze – Piano Nazionale Lauree Scientifiche per una classe 5a del Liceo Scientifico 

Data: 14 marzo presso il Laboratorio di Biologia Sperimentale ore 14:30 – 17:30

Attività di laboratorio previste:

• Digestione di DNA con enzimi di restrizione
• Elettroforesi di DNA in gel di agarosio

Durante le attività pratiche verranno spiegate le procedure  per la digestione di DNA con enzimi di restrizione  e le caratteristiche della elettroforesi mirata alla separazione di molecole di acidi nucleici

Aula D2 – Digestione EcoRI del 140317 di un frammento di rDNA di S. cerevisiae lungo 841 bp

Legenda. M = Marcatore di pesi molecolari 100 bp DNA Step Ladder (Ditta Promega), sono evidenziate le lunghezze di alcuni frammenti in bp, coppie di basi. I campioni hanno i codici delle digestioni EcoRI fatte dagli studenti; Doc, Prof. Trepolari. Nel campione 6B, più che negli altri si nota una digestione non completa. Oltre ai due prodotti finali è presente ancora un frammento più grande che corrisponde al DNA non tagliato.

Liceo Scientifico Gandini di Lodi – Settimana della partecipazione studentesca 6 – 11 marzo 2017

Data: 9 marzo 2017,  Aula Magna del Liceo Scientifico Gandini ore 11.00 – 12:30

Conferenza-lezione del Prof. Luca Ferretti (DBB Università degli studi di Pavia) sulle applicazioni dell’ingegneria genetica e sulle più significative scoperte delle biotecnologie molecolari

Cir.173: settimana della partecipazione – programma conferenze 6/11 marzo

Attività di promozione del laboratorio di scienze – Piano Nazionale Lauree Scientifiche per due classi dell’ITIS Caramuel di Vigevano

Data: 20 febbraio 2017 presso il Laboratorio di Biologia Sperimentale ore 9:00 – 13:00; 14:00 – 17:30

Attività di laboratorio previste:

• Reazione di PCR
• Digestione di DNA con enzimi di restrizione
• Elettroforesi di DNA in gel di agarosio

Durante le attività pratiche verranno spiegate le procedure della reazione di PCR, della digestione di DNA con enzimi di restrizione  e le caratteristiche della elettroforesi mirata alla separazione di molecole di acidi nucleici

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Attività di promozione del laboratorio di scienze – Piano Nazionale Lauree Scientifiche per una classe dell’ITAS Gallini

Data: 16 febbraio 2017 presso il Laboratorio di Biologia Sperimentale ore 9:00 – 13:00; 14:00 – 17:30

Attività di laboratorio previste:

• Creazione di plasmidi ricombinanti mediante reazione di ligasi in vitro tra podotto di PCR e vettore plasmidico
• Trasformazione delle miscele di ligasi in cellule competenti di Escherichia coli
• Preparazione di piastre di terreno selettivo e piastramento delle miscele di ligasi
• Durante le attività pratiche verranno spiegate le procedure della reazione di ligasi, della preparazione di cellule competenti e della selezione dei trasformanti ricombinanti con la selezione blu/bianco (alfa-complementazione di attività beta-galattosidasica)

Attività di promozione del laboratorio di scienze – Piano Nazionale Lauree Scientifiche – Liceo Taramelli.

Data: 8 e 9 febbraio 2017 presso il Laboratorio di Biologia Sperimentale ore 8:30 – 13:30

Classi 3aA 3aF 3aB 3aG. Numero studenti: 74

Attività di laboratorio previste:

• Amplificazione in vitro di DNA da lievito Saccharomyces cerevisiae mediante PCR
• Preparazione di gel di agarosio
• Elettroforesi su gel di agaraosio dei prodotti della PCR e analisi dei risultati

11 e 17 gennaio 2017 presso il Laboratorio di Biologia Sperimentale

Quinto incontro del ciclo Approfondiamo le Biotecnologie, corso di formazione per insegnanti di Scienze e Chimica di scuole secondarie di primo e secondo grado organizzato dalla Associazione Nazionale Insegnanti Scienze Naturali – Sezione di Pavia (ANISN) con la partecipazione del DBB nel contesto del Piano Nazionale Lauree Scientifiche.

L’attività prevede la preparazione di una reazione di ligasi utilizzando un vettore plasmidico  e un inserto rappresentato da un DNA ribosomale di lievito (Saccaromyces cerevisiae) amplificato mediante PCR. Il clonaggio molecolare oggetto dell’attività è l’occasione per spiegare il meccanismo dell’alfa-complementazione della beta-Galattosidasi nel ceppo di E. coli DH5alfa.

La miscela di ligasi viene poi usata per trasformare cellule competenti del ceppo di E. coli DH5alfa su piastre di terreno per la selezione dei cloni ricombinati (selezione “blu/bianco”).

L’attività è completata da una lezione sul meccanismo della trasformazione e della competenza.

Procedura dettagliata clonaggio molecolare e trasformazione 
Lezione trasformazione competenza 

Classi ospitate: 5DLS – 19 studenti
Docenti accompagnatori: Prof. Giulio Marinoni.

Attività svolta
Nel corso del pomeriggio gli studenti hanno svolto attività teorico-pratiche nel laboratorio didattico D2. In particolare ciascuno di loro ha eseguito :

• la digestione di un prodotto di PCR corrispondente a una porzione di uno dei geni  rDNA di Saccarmyces cerevisiae con l’enzima di restrizione EcoRI;
• la separazione dei prodotti del taglio con EcoRI su gel di agarosio e la valutazione dei risultati ottenuti

Durante le pause dell’attività pratica gli studenti hanno approfondito con i docenti gli argomenti della elettroforesi e degli enzimi di restrizione.